2021年8月18日，国家自然科学基金委员会发布消息，公布2021年度国家自然科学基金集中期项目评审结果。我院共有21项项目获批，其中，重点项目1项（刘志飞教授），优青项目1项（黄恩清副教授），面上项目10项，青年项目8项，专项项目1项。目前，我院尚有部分非集中期基金项目正在评审中，有望取得新的进展。
学院历来重视国家自然科学基金的组织申报及辅导工作，在积极鼓励学院教师申报的同时，也多次邀请学校有经验的专家教授亲自来学院进行辅导，学院基金获批率较高，在人才项目、重点项目上取得较好的成绩。
近年来，学院围绕国家海洋和海底资源发展战略的重大需求，依托国家自然科学基金重大研究计划——南海深海过程演变等重要项目，已在南海海洋科学研究方面取得一系列突破成果，使南海成为全球深海研究程度最高的边缘海，确立了我国在南海深海科学研究中的国际主导权。
